农业科学叙词表的SKOS转化及其应用研究*
鲜国建, 赵瑞雪, 朱亮, 寇远涛
中国农业科学院农业信息研究所 北京 100081
摘要

采用W3C推荐的标准SKOS将农业科学叙词表(CAT)中的叙词及词间语义关系进行描述,通过编写转化程序,将存放于数据库中的CAT自动批量地转化为CAT/SKOS格式。基于转化得到的CAT/SKOS以及开源全文检索引擎Solr和优化后的Lucene-SKOS插件,完成了百万级中外文农业科技期刊文摘的语义索引。同时,基于CAT/SKOS中的语义关系,实现一个可支持跨中英双语、可扩展和重构检索条件的智能检索原型系统,并对CAT在关联数据的构建与应用等方面进行展望。

关键词: 农业科学叙词表; SKOS; Lucene-SKOS; 语义索引; 语义检索
中图分类号:G25
Conversion and Consumption of Chinese Agricultural Thesaurus as SKOS
Xian Guojian, Zhao Ruixue, Zhu Liang, Kou Yuantao
Institute of Agricultural Information, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
Abstract

This paper represents the descriptor, non-descriptor and semantic relationships of Chinese Agricultural Thesaurus (CAT) as SKOS, and develops an application to convert CAT to CAT/SKOS automatically, and indexes millions of agricultural abstracts semantically based on CAT/SKOS, Solr and the improved Lucene-SKOS plugin. Then it realizes a semantic retrieval prototype system, which supports cross-language search (Chinese and English), and can also extend and reconstruct the query based on semantic relationship in CAT/SKOS. Finally, the authors make some prospects on the future applications of CAT/SKOS such as the publication as Linked Data.

Keyword: Chinese agricultural thesaurus; SKOS; Lucene-SKOS; Semantic indexing Semantic retrieval
1 引言

在构建语义网络的过程中,尤其是从传统的文件网络(Web of Document)向具有结构化和富含语义的数据网络(Web of Data)演进过程中[ 1],传统知识组织系统(如叙词表、主题词表、分类法等)正在发挥越来越重要的作用。然而,在当前网络信息环境下,这些知识组织系统也需要与时俱进,为适应新的需求变化而不断推进其自身的发展和进化。

农业科学叙词表(Chinese Agricultural Thesaurus, CAT)作为一部大型、综合性农业叙词表,共收录了包括农业、林业、生物等领域在内的6万多个叙词、非叙词以及13万多条词间语义关系,为有效组织和利用我国的农业信息资源发挥了重要作用。近几年,针对CAT开展了大量的研究与实践,如将CAT中叙词及词间关系转换为资源描述框架(Resource Description Framework, RDF)、本体网络语言(Ontology Web Language,OWL)格式的轻量级本体[ 2, 3],与FAO合作完成CAT与AGROVOC叙词表的映射[ 4]。然而,与互联网创始人Berners-Lee[ 5]提出的五

星级评价标准相比,目前的农业科学叙词表仅能获得两到三颗星,因为其还没有完全对外开放,也未提供便捷的获取和利用途径,所以非常有必要采用包括RDF、SKOS、SPARQL和关联数据等被推崇的开放标准和最佳实践,使农业科学叙词表变得更加开放、有用、可用和尽可能地被更多利用。

本文在简要介绍SKOS的基础上,将农业科学叙词表中的叙词、词间关系用SKOS提供的语言标签进行描述,并通过开发的转化程序,自动批量地将CAT向CAT/SKOS转化。基于CAT/SKOS、开源的全文检索系统Solr及其插件Lucene-SKOS,完成了对百万级中外文农业科技文摘数据的语义索引,最后实现简易的智能检索原型系统。

2 CAT向CAT/SKOS的转化
2.1 SKOS简介

简单知识组织系统(Simple Knowledge Organization System,SKOS)是W3C在2005年制定的规范标准,是以资源描述框架(RDF)为基础,为知识组织体系(包括叙词表、分类法、主题词表、术语表等)提供了一套简单、灵活、可扩展的机器可理解的描述和转化机制,目的是为了资源的共享和重用。SKOS由核心词汇(SKOS Core)、映射词汇(SKOS Mapping)和扩展词汇(SKOS Extensions)三部分组成。其中比较成熟的是SKOS Core,已经形成了相应的语法标准和应用标准,而后两者目前还处于发展阶段。

在提出SKOS标准后,国内外的图书情报界已开展了一系列的知识组织系统的SKOS描述转化研究,如荷兰视听档案通用词汇表(GTAA)[ 6]、医学主题词表(MeSH)[ 7] 、美国国会图书馆标题表(LCSH)[ 8] 、FAO多语种农业叙词表AGROVOC[ 9]等;2009 年,《杜威十进分类法》(简称DDC)以SKOS 格式发布[ 10],目前提供了前三级类目数据的开放下载;张士男等[ 11]提出了《中国科学院图书馆图书分类法》中类目、类号、关系、类目注释等的SKOS 转换;刘丽斌等[ 12]建立了《中国分类主题词表》的SKOS描述自动转换方案。

2.2 CAT的SKOS表达

笔者曾利用本体描述语言OWL对CAT进行了规范化描述和转化,但由于OWL语义描述很强,在常规语义网络环境下难以加以应用并发挥其功能,而具有轻量级语义描述能力和更广泛应用场景的SKOS,能最大程度地兼容传统知识组织体系,实现其在网络环境下的转化和应用。因此,本文将基于SKOS的描述词汇,并借鉴国内外知识组织系统向SKOS转换的经验,实现农业科学叙词表CAT向SKOS的转换。

(1)叙词向概念转化

在将CAT向SKOS转换时,每个叙词都将被转化为SKOS的一个概念。作为SKOS的概念,唯一标识符(URIs)是必备要素,用以唯一标识skos: Concepts的实例。在关联数据的构建实践过程中,推崇应用HTTP URLs来标识资源。CAT的叙词及非叙词都拥有一个稳定、唯一的编号(Term-Code)。因此,在将叙词转换为概念时,term-code将作为HTTP URL模板“http://aii.caas.net.cn/cat/concept/{term-code}”的一部分,以确保可通过稳定的URLs来解析CAT中的各个概念。

(2)标签属性的应用

SKOS提供了skos:prefLabel和skos:altLabel等标签属性,以将优选和替换的自然语言标签与特定概念相关联。本文将CAT叙词的中文字符串和英文对译字符串分别映射为带有语言标记的skos:prefLabel,而其“代”的非叙词则以同样带语言标记的skos:altLabel来表达。

(3)语义关系的转化

农业科学叙词表中的语义关系主要包括“用、代、属、分、参”等类型。“用、代”已通过标签属性进行了表达,本文采用skos:broader、skos:narrower和skos:related来分别转化“属、分、参”三种关系。在描述CAT与AGROVOC这两个叙词表的映射成果时,则主要应用skos:inScheme、skos:narrowMatch和skos:broaderMatch等词汇。在转化后的CAT/SKOS中,所有概念资源之间都通过它们的唯一标识符URIs来建立各种语义关联关系。利用SKOS的数据描述模型,将CAT中叙词“大豆”知识片断及其与AGROVOC映射成果的描述如图1所示:

图1 农业科学叙词表的SKOS描述

2.3 CAT向CAT/SKOS的批量转化

笔者开发设计了自动批量转化程序,将CAT中6万多个叙词、非叙词,以及13万余条词间关系自动批量转化为SKOS格式的RDF文档,转化结果如图2所示:

图2 农业科学叙词表向SKOS的批量转化结果

3 基于CAT/SKOS的语义索引及智能检索

通过对农业科学叙词表基于SKOS开展转化研究,形成了CAT的SKOS版(CAT/SKOS)。在CAT/SKOS这一RDF文档中,已通过规范的语义标签建立了丰富的内外部语义关联关系,已是真正意义上的关联数据,这将为基于CAT/SKOS开展新型知识服务应用奠定良好的语义资源基础。本文将基于CAT/SKOS、开源软件Solr和农业科技期刊文摘数据库来开展语义索引和智能检索等方面的研究和实践。

3.1 全文检索引擎Solr 和 Lucene-SKOS插件

Solr是在全文索引工具Lucene基础上进行了封装和功能扩展,它是一个高性能的、可独立运行的企业级全文搜索引擎服务器。Solr在2007年正式成为Apache的子项目后,先后共发布了多个版本,最新版为2012年7月发布的Solr 3.6.11[ 13]。目前,Solr能为多种数据格式提供全文索引、检索、分面浏览、高亮显示、富文档处理、分布式检索、索引复制和空间数据检索等强大功能。

此外,Solr还提供了可灵活扩展的插件体系架构,用户可根据实际需要进行自定义扩展和配置。Lucene-SKOS就是基于该体系而实现的语义索引和检索插件。实质上,Lucene-SKOS是为Apache Lucene和Solr定制的一个分析器模块,它以存在于SKOS中的概念及其语义关系为基础,为建立Lucene文档索引及执行查询条件提供术语扩展。该插件目前支持两种形式的术语语义扩展:基于唯一标识符URI的扩展和基于字符串标签的扩展[ 14]

3.2 基于CAT/SKOS构建语义索引

在测试Lucene-SKOS过程中,笔者发现该插件还存在一些不足。在启动Solr后,该插件首先会将指定的整个SKOS文档基于Jena进行解析,并将解析结果(如唯一标识符URI、概念、属性标签和语义关系等)在内存中建立对应的Lucene索引。然而,一旦SKOS文档较大 (比如20MB),该插件就可能因内存不足而停止工作。在分析源码过程中还发现,该插件在进行语义扩展时,只考虑了“用、代、属、分”关系,没有将“参”纳入扩展范围。因此,笔者对该插件进行如下改进和完善:

(1)新增了可以加载磁盘中现成索引文件(事先建立SKOS的Lucnce索引,没有大小限制)的初始化函数,代码片断如下所示:

public SKOSEngineImpl(String indexFilePath) throws IOException {

this.indexDir = new SimpleFSDirectory(new File(indexFilePath));

this.searcher = new IndexSearcher(indexDir);

System.out.println("SimpleFSDirectory created"); }

(2)对源代码中的SKOSFilterFactory.java文件也作了相应修改,包括添加成员变量indexFilePath,重写inform(ResourceLoader loader)方法,确保该插件能支持指定SKOS文件和指定其索引文件两种模式。由于转化得到的CAT/SKOS文档较大,为避免解析该文档导致内存溢出的问题,笔者基于存放于关系型数据库的CAT构建了符合该插件规范的Lucene索引文件。

国家农业图书馆经过多年的数字化建设,已建成了专业领域集中、元数据著录完整规范、学术价值较高的中外文农业科技期刊文摘数据库。笔者利用Solr和改进后的Lucene-SKOS插件,并基于CAT/SKOS索引文件,对400多万条文摘数据建立了语义索引(基于字符串标签的术语语义扩展模式)。为避免过多的语义扩展,目前只在关键词和题名这两个字段建立了语义索引。若在文摘或全文层次建立语义索引,不但会导致索引文件急剧增大,也会导致过多的语义扩展,影响检索结果。

3.3 基于CAT/SKOS的智能检索原型系统

基于建立的农业科技文摘语义索引文件和开源前端展示交互脚本库Ajax-Solr[ 15],实现了基于CAT/SKOS进行语义扩展的智能检索原型系统。除Solr提供的全文检索、检索结果高亮显示、分面浏览与检索、相似文献检索等强大功能外,该系统还支持对关键词字段进行中英双语检索,以及基于农业科学叙词表中丰富的词间关系,进行检索条件的语义扩展和重构,如图3图4所示:

图3 基于CAT/SKOS的智能检索原型系统(只检索中文)

图4 基于CAT/SKOS的智能检索原型系统(中英双语检索)

可以看出,在基于CAT/SKOS实现语义索引基础上,即使用户只输入中文检索词“大豆”,在命中结果中包含与“大豆”对应的“黄豆”、“青豆”、“Soybean”等语义密切相关的其他中英文词的信息也被检索出来,因此,简单的智能检索功能基本实现。通过点击页面左边的分页检索智能导航区域的超链接,则可以直接检索与“大豆”存在语义关系的其他词的信息,实现了简单的智能导航功能。

4 结语

本文利用SKOS对农业科学叙词表中的叙词及词间关系进行了描述,并将其批量地转化为具有关联数据特性的CAT/SKOS。同时,基于开源软件建立了农业科技文摘数据的语义索引和智能检索原型系统,实现将叙词表嵌入检索系统,提高了检索效率。近年来,关联数据作为一种被推荐的最佳实践,广泛应用于语义网,通过使用URIs和RDF发布、分享、连接各类数据、信息和知识[ 16]。以下工作将进一步开展:把CAT/SKOS发布为公开的关联数据,提供SPARQL查询终端、RDF片断/文档下载等服务,并与AGROVOC、LOD云图中的其他开放关联数据进行语义映射和广泛互联;在CAT的应用方面,继续完善智能检索原型系统的各项功能,将“参”关系也纳入语义扩展范围,支持语义关系扩展类型任意组合的自定义设置,并且以可视化方式将语义扩展和查询条件重构的结果和链接提供给用户。

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(作者E-mail: xgj@mail. caas. net. cn) [本文引用:1] [JCR: 4.826]