云计算、便携移动计算设备构成了当前数字信息环境的主要框架,人们利用智能手机、各种类型的平板电脑获取信息,并把个人信息和资源储存在云端,通过无所不在的网络管理和使用信息。iPad就是一个典型的云计算框架下的便携计算设备,近年来在教育科研行业的应用越来越广泛和深入。物理学家发现在学术会议上越来越多的人使用iPad代替笔记本电脑^{[ 1]};心脏病医生发现随身携带iPad为工作带来很大的便利,使用iPad可以即时录入病例信息,随时上网查阅专业资料^{[ 2]};生物学家发现使用iPad搜集和录入数据要比PC效率高出很多;野外作业的科学家发现一台iPad就能够代替以往的地图、手持GPS设备、照相机、测距仪、记录数据的记事本等一堆沉重的设备^{[ 3]}。

不少图书馆也对iPad在数字阅读、图书馆业务方面的应用做了研究。2011年,莫里斯图书馆的馆员测试了使用iPad做参考咨询服务的效果^{[ 4]}。德克萨斯农工大学图书馆的馆员研究了图书馆用iPad代替普通PC进行文献管理工作的可行性^{[ 5]}。很多美国高校开展了iPad或其他平板电脑在高等教育环境下的应用研究^{[ 6, 7, 8, 9, 10]}。这些研究都表明,平板电脑具有电池续航时间长、用户界面体验更人性化、更丰富的设备接口、更轻便易于携带的优点,平板电脑很可能成为数字化学习和数字科研的主力军。对于高校和研究机构的人员而言,主导日常研究和学

习工作的重要元素是科学文献的管理、阅读和利用,通常使用参考文献管理软件完成这一系列工作。本文对iPad上的4种文献管理软件进行了介绍、分类和对比,分析了这4种软件的各自的特点和优势。

iOS平台上的文献管理软件主要有4种:Papers、Sente Reference Manager、Mendeley和Bookends On Tap。这4种软件分别都有基于Windows或Mac平台的版本,同时具有iOS版本方便用户在移动环境中使用。其中Papers、Sente Reference Manager和Bookends都需要付费使用,Mendeley是免费软件。

(1)Papers^{[ 11]}

Papers是Mekentosj开发的产品,2007年Papers获得了苹果公司的科学计算方案最佳设计奖。Papers具有Mac、Windows和iOS三个平台的版本,其在苹果平台用户中的知名度较高。

(2)Sente Reference Manager for iPad^{[ 12]}

Sente 由Third Street Software于2004年开发,只有Mac和iOS两种平台的版本。除付费版本的Sente Reference Manager for iPad以外,App Store内还有一款功能较少的Sente Viewer供免费下载。

(3)Mendeley^{[ 13]}

Mendeley于2008年初问世,是一款带有社会网络功能的免费文献管理软件,2009年获得欧洲“TechCrunch助益社会的最佳社会网络创新”大奖。Mendeley支持Mac、Windows和iOS平台。

(4)Bookends On Tap^{[ 14]}

Bookends On Tap由Sonnysoftware开发,Bookends只有在Mac和iOS平台上的版本,不支持Windows平台用户。

文献管理软件的重要功能是能够方便地检索专业资源数据库、获取和导入学术文献,建立个人的学术文献资源数据库。研究资料的获取途径主要包括:

(1)从内置的科学文献搜索引擎中直接搜索谷歌学术、Web of Science等常用的数据源;

(2)导入从其他途径获取的PDF文档并自动生成和更新题录信息;

(3)导入各种格式的题录,快速生成个人文献资源库;

(4)同步已经建立好的个人文献资源库。

Papers内置了ACM、ADS、arXiv、Google Scholar、IEEE Xplore、JSTOR、PubMed、Web of Science等8个数字资源接口,用户在软件内可以直接检索以上的数字资源,并下载有使用权限的文献。Papers能通过iTunes批量导入电脑中已有的PDF文档,可以从Dropbox云存储中导入PDF文档数据,通过在内置的数字资源上检索,Papers可以自动更新文献元数据。目前研究人员同时使用多台计算机设备的情况很常见,在实验室内使用计算能力更强的台式机或笔记本电脑,在外出开会或上课时使用iPad这样的便携设备,如果数据资源被更新后不能在几台设备上自动同步就会导致几台设备上的资源库数据不一致,造成使用上的不便。iOS系统上的文献管理软件多数考虑到这一需求。Papers可以通过Wi-Fi网络同步在iOS或Windows平台上的Papers软件中的文献资源库。

Sente通过内置浏览器可以获取包括Web of Knowledge、Google Scholar、ProQuest、Oxford Journals、Library of Congress等74个预先内置的数字资源库和在线电子期刊的网站的文献资源。Sente无法从iTunes导入PDF文档,但是可以导入Bib格式的参考文献数据,也可以导入由Mac平台的Sente生成的个人文档库备份。通过采取互联网的云同步方式,Sente无需与其他设备在一个局域网内才能同步,研究者在外出差时同样可以通过互联网更新备份在云端的数据。

与其他版本的Mendeley一样,用户可以通过访问Mendeley站点检索数据,并通过点击“Add to My Library”链接,将检索到的数据加入个人图书馆。此外,Mendeley还可以通过在Safari浏览器中添加一个JavaScript标签,在浏览Mendeley所支持的42个数据资源时,点击这个标签就能自动收集数据到Mendeley的账户中。打开Mendeley的客户端后,文档资源就会自动同步更新。Mendeley采用云同步方式能够同步在不同平台上的数据资源。

Bookends On Tap内置了PubMed、Google Scholar、JSTOR、arXiv、Web of Science和Library of Congress等6个资源,与Papers相似,Bookends采用Wi-Fi同步方式。Bookends不支持由iTunes直接导入PDF文档的方法,只能通过同步或者在线搜索获取文献。Bookends基于Mac平台的版本具有更多的内置数字资源可供检索。

表1和表2对这几款软件的数据获取、导入和同步功能进行了总结。

表1

表1

表1 在线搜索功能对比 软件名称 资源 方式 Papers ACM、ADS、arXiv、Google Scholar、IEEE Xplore、JSTOR、PubMed、Web of Science 8个资源 内置搜索接口,不可定制,直接下载文档和记录 Sente Reference Management for iPad Web of Knowledge、Google Scholar、ProQuest、Oxford Journals、Library of Congress等74个内置数字资源 通过内置浏览器搜索,下载文档或抓取参考文献题录 Mendeley Mendeley网站内资源; 通过浏览器标签抓取含Web of Knowledge、Google Scholar 等42个主流数据资源 可以通过Safari访问Mendeley站内检索;通过安装Mendeley浏览器插件抓取和导入42个数据源的题录信息到Mendeley的云端 Bookends On Tap Google Scholar、PubMed、JSTOR、Library of Congress、arXiv、Web of Science等6个资源 通过内置接口检索并下载题录和文献

表1 在线搜索功能对比

表2

表2

表2 数据导入功能对比 软件名称 数据导入方式 导入格式 同步 Papers iTunes\Dropbox PDF Wi-Fi Sente iTunes Bib 云 Mendeley 无 无 云 Bookends On Tap 无 无 Wi-Fi

表2 数据导入功能对比

对比可检索数据资源的数量,Sente和Mendeley较为优秀,Sente可以检索74个数据资源,而Mendeley除了可以检索42个数据库资源外还可以检索Mendeley自身的数据库。比较导入PDF文档和其他格式的数据的功能,Papers更方便,不仅可以支持iTunes直接导入,还可以导入云存储的PDF文档。4个软件的设计思路都是作为PC平台的移动补充,都可以通过云或者Wi-Fi与PC平台版本软件数据资源同步。因为所有的iOS平台的文献管理软件都不是被设计成独立使用的,在选择iOS平台版本的文献管理软件时必须考虑其PC版本的功能。表3简明列出了这4种软件的PC版本的特性。

文献的组织和管理主要包括分组、标签、评分、标注、元数据管理和检索等功能。分组方法分为用户定制分组和智能分组两种。标签和评分、标注也是管理文档的常用方法。为了方便研究者之间的信息交流,多数文献管理软件提供了各种不同方式的文献共享。

表3

表3

表3 PC版本的文献管理软件数据搜索和导入功能 软件名称 内置数据资源 数据导入格式 导入 PDF 平台 Papers 十几个内置资源 BibTex,RIS 支持 Windows/Mac/iOS Sente 与iOS端的数字资源数目相当 BibTex,EndNote XML 支持 Mac/iOS Mendeley 浏览器工具条能抓取40多种常用数据库记录 BibTex,EndNote XML,RIS,Reprint/Medlars 支持 Windows/Mac/iOS Bookends 内置几十种常见数据资源和很多大学图书馆资源 用户自定义过滤器 支持 Mac/iOS

表3 PC版本的文献管理软件数据搜索和导入功能

Papers具有智能分组和人工分组两种功能,人工分组可以建立多级目录。Papers允许用户自己给文章添加关键词,但是这些关键词无法分级,只能在一个平面上。Papers可以给文章加标志(Flag)和评分(Rating),可以给文章加注释(Note),对文章做简单的标注。Papers提供个人资源库内的文献题录的全文检索。Paper把标注分为Note和Social Feature两种,前者是用户私有的,后者是用于分享文献时给其他人的标注信息。Papers创建了具有社会网络功能的Livfe Collection,通过这个功能,用户可以将自己资源库中的部分文献共享到云端,与其他合作者分享和讨论,但是iOS平台上的版本尚不具备此功能。Papers也可以通过邮件、Wi-Fi和Tweet与他人分享文献。

Sente的分组管理理念与其他软件有很大不同。在iOS平台上,Sente的智能分组功能非常好,不仅能够根据作者、期刊分组,还能够根据年代、Tag、状态、评分、时间来智能分类。最大的亮点是Sente的标签提供分级功能,例如一篇关于生物计算的文献,可以建立三个一级Tag:生物学、软件、技术,在每一个一级Tag下,可以再加入更详细的描述文献内容的标签。这种分级方法是建立在用户准确详细描述文档基础上的智能分组,需要用户养成良好的文献标注习惯。Sente采用对题录进行全文检索的方式检索本地资源库。Sente可以通过邮件及云共享来与其他研究者分享文献,并且会将作者的注释一并共享。

Mendeley的iOS版本完全同步了云端的数据,在iOS端,完全不具备分组的功能,用户只能沿用云端的分组。iOS端允许用户修改文献的状态,例如是否需要评论,是否是喜欢的文档,允许增加标签和注释作为题录数据的一部分。Mendeley允许用户在本资源库内全文检索题录。在Mendeley客户端,允许用户通过邮件共享文献。在iOS平台上,用户可以通过Safari登录Mendeley网站,通过社会网络共享和交流文献。

Bookends支持人工静态分组和智能分组两种方式。在iOS端和PC端的分组和标识功能相差不多,具有标注、颜色标签、评分、关键词和4个自定义字段的标注功能。Bookends可以通过邮件和Wi-Fi网络传递和分享文献。

这4种文献管理软件的功能对比,如表4所示:

表4

表4

表4 文献管理功能对比 软件名称 标识 分组 支持多库 搜索 共享 Papers Tag/Rating/Note/Social Feature/Mark/Color Label/ Flag 静态多级分组/智能扁平分组 支持多个 Library 题录全文 检索 Wi-Fi共享/邮件共享/Tweet/Livfe Collection社 会网络(仅限PC平台) Sente Tag(Hierarchy)/Rating/5 Status/Note 静态扁平分组/智能多级分组 不支持 题录全文 检索 邮件共享/云共享(非社会网络) Mendeley Tag/Reviewed Status(Boolean)/Favorite Status(Boolean)/Note/ Keywords 继承PC平台上的分组/静态分组为主/iOS端不能改变分组 不支持 题录全文 检索 邮件共享/云端的社会网络共享 Bookends Note/Color Label/Rating/Keywords/4 User Defined Field 静态扁平分组/智能扁平分组 支持多个 Library 作者/题 目/摘要 Wi-Fi共享/邮件共享

表4 文献管理功能对比

4种软件的文献管理功能各有特长,其中Sente的智能分组功能最具特色。图1显示了Sente范例库中一篇文档的多级标注。多级标注功能允许用户按照知识体系对文献分级管理,是一种科学的做法。但是需要用户具有较完善的知识组织和分类的思维,并且要在仔细阅读完文献后才能标注出准确的多级标签。依靠智能标签的分组非常灵活,也更容易组织,用户随时可以根据不同的需要和不同的学科视角重组个人资源库内的文献。Papers允许建立多级手工目录,其他软件都只能使用单级目录。所有软件提供的标识和分组信息都可以在iOS平台和PC平台之间同步。

图1

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	图1 Sente软件的多级标签

Mendeley和Papers提供文献分享的社会网络功能,但是在iOS平台端,Papers目前无法使用文献共享的社会网络功能,其社会网络功能只能在PC平台使用。Sente和Bookends只能通过部分文献的同步功能来实现与其他合作者的文献共享,其中Sente使用基于互联网的云同步,而Bookends使用基于Wi-Fi的本地网络共享。如果用户需要与科研团队或教学对象经常分享研究文献,那么选择带有社会网络功能的Mendeley和Papers更能够满足需求。

科研人员在阅读科学文献时,常常需要在文献中标识一些重要信息,例如高亮重要的段落、注释个人的思考、引用关键的语句。在这4款软件中,Mendeley和Bookends在iOS平台只能阅读而不能注释文档,虽然iOS平台的其他阅读软件也拥有丰富强大的注释功能,但是这些注释信息无法通过文献管理软件同步到PC平台中,造成在iPad上阅读文献过程中生成的注释信息无法被有效地管理起来。

Papers和Sente软件支持在iOS平台阅读和注释文档,这些注释信息会被完整地同步到其他客户端,保证用户在不同平台切换时信息的完整。Papers的标注功能相对Sente要少一些,Papers允许高亮文字,允许加入注释,但是注释的位置却不能移动,只能在高亮文字的旁边用一个红色的大头针表示,此外Papers也无法将所有的注释信息集中显示,只能在文档中阅读。Sente允许用不同的颜色高亮显示文本,允许加入评论,可以引用一段文字并加入用户个人评论,所有的注释信息可以自动生成一份整合的文献概览信息。表5比较了这4种软件的文献阅读功能,图2显示了Papers和Sente的标注效果。

表5

表5

表5 文献阅读功能比较 软件名称 阅读 高亮 文字注释 注释信息整合 Papers √ √ √ Sente √ √ √ √ Mendeley √ Bookends √

表5 文献阅读功能比较

图2

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	图2 Papers和Sente的标注效果

对比4款软件在iOS平台的阅读注释功能,Sente是最为完善的,Papers也能满足基本需求,其他两款软件只能阅读,无法注释。

这4款软件各有特色,用户可根据个人需要和条件选择:Sente和Mendeley在iOS平台上支持检索的数据源比较丰富,满足数据检索范围较大的用户;如果用户目前基于Windows平台工作,那么Papers和Mendeley这两款软件支持Windows平台;如果用户需要与团队经常交流,那么具有社会网络功能的Mendeley和Papers是不错的选择;如果用户希望在iPad上阅读文献时能够使用标注功能,并希望这些信息在不同平台切换的过程中得以保留,那么Sente和Papers都符合要求;如果用户喜欢丰富完善的知识管理体系,那么Sente支持多级知识体系的标签功能;从经济方面考虑Mendeley是一款免费软件。让人困扰的是,并没有一个软件拥有所有的优势,用户只能根据需求去选择。

由于平板电脑的便携性和用户界面的人性化,其在阅读文献过程中有天然的优势:平板电脑的尺寸和重量都与图书相仿,能够自如地缩放页面,根据图书的版面横放或竖放;阅读过程中,不用其他外设,仅仅使用手指就可以做记录、圈写和注释;平板电脑的电池续航时间远长于笔记本电脑,在电源不便利的课堂、会议、旅途中都可以使用。有人大胆预测,在未来的大学里,平板电脑会代替学生们的笔记本电脑。但是目前看来,平板电脑还不能完全替代笔记本电脑完成所有的学习和研究工作,iOS平台的文字处理软件和文献管理软件都不支持在文档编辑过程中自动加入参考文献(Citation)的功能,因此独立使用iPad无法完成科研工作者阅读、引用、写作的全部流程。目前iPad只能够作为用户检索和阅读文献的工具,作为PC平台文献管理工具的补充。